显微CT可以在不破坏样本的情况下清楚获取样本内部详尽的三维结构信息。以活体小动物显微CT对大鼠股骨骨小梁进行分析评价的实验为例，展示了用气体麻醉装置麻醉活体小动物的基本操作流程、显微CT的基本扫描参数的设置、数据分析中感兴趣区域（ROI，Region of Interest）的选取及数据报告中各项骨参数的含义等各步骤的操作方法，为骨小梁微观结构的显微CT评价提供了参考依据。